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  1. 公众号:单细胞天地84

    Nature 研究鉴定癌前效应性 Treg 细胞轴,PI3Kδ 抑制可在小鼠中拦截肺癌发生

    一项发表于 Nature 的研究整合单细胞 RNA 测序、TCR 测序与 Xenium 空间转录组,在高级别癌前气道病变中鉴定出 BATF+ 效应性 Treg 细胞,并构建了淋巴结—循环—气道的跨组织调控轴。

    推荐理由:研究把肺癌免疫干预窗口前移到癌前阶段,并用跨组织克隆共享与空间结构给出可追踪的细胞轴。

  1. Nature Genetics75

    人胰腺导管腺癌克隆异质性及其对肿瘤进展的影响

    研究团队对 62 例原发胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤进行单细胞 RNA 测序(443,451 个细胞),并对其中 11 例肿瘤匹配空间转录组(53,236 个 spot),同时纳入 6 例化疗前后配对样本,刻画克隆、转录与空间多样性。分析发现同一肿瘤内共存多个遗传上不同的肿瘤克隆,克隆特异的配体-受体程序受基因组剂量调控:配体或受体扩增增强相应互作,缺失则抑制,空间转录组与多重免疫荧光支持这些遗传编码差异。

    推荐理由:62 例原发肿瘤的单细胞与空间转录组图谱,把克隆异质性、8q24/MYC 扩增与经典-基底表型转换联系起来。

  1. 中国科学院遗传与发育生物学研究所88

    杨维才团队与国内多家单位合作在 Cell 发表水稻全生命周期三维时空细胞图谱

    中国科学院遗传与发育生物学研究所杨维才团队与国内多家单位合作,在 Cell 在线发表水稻全生命周期时空组图谱研究,以粳稻品种中花11为材料,结合高分辨率空间转录组、单核RNA测序和人工智能分析,构建了覆盖种子萌发到开花结实全过程的三维时空细胞图谱。

    推荐理由:图谱覆盖水稻10个器官、61个发育阶段,并配套在线平台与RICE scGPT基础模型,可供植物单细胞与空间组学研究复用。

  1. Molecular Systems Biology67

    整合空间信息的正常与癌症相关结肠成纤维细胞图谱

    研究结合大规模单细胞 RNA 测序、空间验证和功能实验,构建了人正常结肠成纤维细胞与间质亚群的参考图谱,并以小鼠结肠为参照。

    推荐理由:该研究以小鼠结肠为参照,用单细胞与空间验证构建人正常结肠和结直肠癌成纤维细胞参考图谱,为 CAF 分型提供统一坐标。

已经到底了