过去 48 小时，生信圈讨论最多的 4 件事
10月20日 04:30 更新 · 按讨论热度排序
Ran Blekhman 在 PLOS Biology 发表评论文章，称 AI 生成论文激增构成一类全新问题，并讨论其对生物学领域科学评价方式的影响。他在 Bluesky 发帖介绍该文，核心论点是：在生成式 AI 时代，写出一篇论文不再意味着真的做过科学研究，因此需要重新考虑如何回应 AI 生成论文的涌入。 Stephen Turner 随后在 Bluesky 和 X 推荐约 5 分钟可读完的短文《What Counts as Impact?》，称该文认为数论文数量和影响因子一直是有缺陷的替代指标，生成式 AI 让这一问题更严重；他同时引用上述关于 AI 生成论文激增及生物学科学评价的观点，并指向 PLOS Biology 的文章。
最新进展Stephen Turner 推荐一篇关于科研影响力的短文
一项研究通过拉曼光谱和宿主-客体质谱捕获方法，在人类线粒体和脂滴中检出环状八硫（S8）。这种元素硫形式此前只在原核生物中见过，在高等动物中未被发现。 作者称，癌组织中S8水平更高，可达100mM以上，并估计正常人体细胞内至少携带数十克元素硫；数据还提示S8由内皮型一氧化氮合酶（eNOS）系统作为独立产物合成，其疏水性可能与抑制脂质过氧化有关。上述含量估计与功能关联均出自研究作者，尚待独立验证。
上海交通大学团队在 Nucleic Acids Research 发布天然转化数据库 NTDB，汇总原核生物天然转化机器与调控基因信息，网址为 https://bioinfo-mml.sjtu.edu.cn/NTDB/。据论文，该库整合文献挖掘并经实验验证的数据，覆盖 118 个天然可转化物种、1072 个转化相关基因和 10 个 DNA 摄取基序。 团队还通过同源搜索，在 12 310 个原核菌株中鉴定出 420 600 个机器基因和 246 164 个调控基因，并附蛋白注释。后续一条 Bluesky 帖文转述了该数据库的发布，称自然转化由专门的机器与调控基因控制，驱动原核生物的进化与适应。
顾江、邹全明团队在 ACS Nano 发表封面研究，以铜绿假单胞菌保护性抗原 GroEL 为自组装纳米支架、展示 PcrV-OprI 融合抗原 rePO，构建 reGroEL-PO 纳米疫苗，并在成年和老年小鼠模型中减轻铜绿假单胞菌肺炎。 为检验克服免疫衰老的能力，团队使用 23 月龄老年小鼠实验；单细胞 RNA 测序显示该疫苗显著增加老年小鼠引流淋巴结中的经典Ⅰ型树突状细胞（cDC1）。短期安全性实验中，reGroEL-PO 在最高 200 微克/毫升测试浓度下未引起明显溶血或细胞毒性。上述结果均为小鼠实验层面。