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  1. Nature Communications72

    10 蛋白组合可从血浆高准确度识别 ALS

    研究团队基于 632 例 ALS 患者和 160 例健康对照的血浆样本,使用 NULISA CNS 与 Inflammation Panel 检测蛋白,并结合 XGBoost、嵌套交叉验证和 SHAP 筛选疾病相关蛋白,最终确定由 NEFL、FOLR1、pTau-181、TREM1、VEGFA、NEFH、CALCA、NRGN、LAMP3 和 PTX3 组成的 10 蛋白组合。该组合在包含 144 例 ALS 患者和 37 例对照的独立验证队列中取得平衡准确率 98.3%、AUC 0.992 的分类表现。

    推荐理由:在 632 例 ALS 患者与 160 例对照中筛出 10 蛋白组合,并在独立队列验证,为血液筛查提供了可复现的候选方案。

  1. 公众号:BioArt82

    Nature:Triana Biomedicines 报道可穿越血脑屏障的 ALK 分子胶降解剂 TRI-611

    美国 Triana Biomedicines 公司的 Vito J. Palombella 和 Andrew R. Conery 在 Nature 发表研究,报道了选择性、可穿越血脑屏障的 ALK 分子胶降解剂 TRI-611。

    推荐理由:报道的分子胶降解剂绕开ALK激酶活性位点,在耐药与颅内模型中仍有效,为靶向蛋白降解提供了新降解基序的结构依据。

  2. Nature Genetics75

    研究揭示人早期胚胎中 Polycomb 抑制格局的建立过程

    研究对人类配子、二细胞胚胎、八细胞胚胎、囊胚和胚胎干细胞中的 H2AK119ub(H2Aub)进行图谱分析,发现 H2Aub 最早在二细胞阶段于 GC 富集区域出现,随后逐步累积,并在后期集中于 PcG 靶基因。

    推荐理由:该研究追踪人胚胎从配子到囊胚的 H2Aub 动态,说明 H2Aub 如何引导 H3K27me3 重建 Polycomb 抑制格局。

  3. Nature Genetics72

    379 个人脑样本图谱将 mRNA 3′端选择与脑疾病遗传风险联系起来

    一项新工作在 379 个人脑样本中绘制了可变多聚腺苷酸化这一转录后调控层,显示 3′-UTR 选择上的遗传变异与疾病相关位点及下游分子效应相关。可变多聚腺苷酸化通过改变 mRNA 末端影响 mRNA 稳定性、翻译或亚细胞定位,而不一定改变 RNA 丰度。

    推荐理由:在 379 个人脑样本中绘制可变多聚腺苷酸化图谱,把 3′-UTR 选择相关的遗传变异与疾病位点及下游分子效应联系起来。

  1. 公众号:单细胞天地84

    Nature 研究鉴定癌前效应性 Treg 细胞轴,PI3Kδ 抑制可在小鼠中拦截肺癌发生

    一项发表于 Nature 的研究整合单细胞 RNA 测序、TCR 测序与 Xenium 空间转录组,在高级别癌前气道病变中鉴定出 BATF+ 效应性 Treg 细胞,并构建了淋巴结—循环—气道的跨组织调控轴。

    推荐理由:研究把肺癌免疫干预窗口前移到癌前阶段,并用跨组织克隆共享与空间结构给出可追踪的细胞轴。

  2. Phys.org88

    AI 从头设计可识别并切割指定蛋白靶点的蛋白酶

    David Baker 团队组合 RFdiffusion2 的 RFD2-MI、ProteinMPNN、EnhancedMPNN 和 AlphaFold 3 从头设计半胱氨酸蛋白酶与锌蛋白酶,两项结果分别发表于 Nature。

    推荐理由:两篇 Nature 论文用 RFdiffusion2、ProteinMPNN 与 AlphaFold 3 组合从头设计蛋白酶,并给出实验验证的成功率与提速幅度。

  1. Institute for Protein Design78

    IPD 团队在 Nature 发表从头设计蛋白酶研究

    美国华盛顿大学蛋白设计研究所(IPD)的 Anqi Chen、Kejia Wu 和 Hojae Choi 从头设计了蛋白酶,这些被称为“分子剪刀”的酶能高精度切割用户指定的目标序列,相关成果本周发表于 Nature。

    推荐理由:IPD 团队在 Nature 报告从头设计蛋白酶,可按用户指定序列切割,为蛋白设计提供新的功能实现路径。

  1. Cell82

    研究基于 467,152 份 UK Biobank 基因组构建全表型结构变异图谱

    研究利用 467,152 份 UK Biobank 基因组构建了全表型结构变异图谱,显示大于 50 bp 的结构变异是人类疾病风险中重要且此前被低估的来源。该资源揭示了与疾病相关的罕见结构变异和调控性结构变异,为理解人类生物学和药物研发提供线索。

    推荐理由:基于近 50 万份 UK Biobank 基因组构建的结构变异图谱,把大于 50 bp 的变异与疾病风险系统关联起来,可作为结构变异研究的参考资源。

  2. Medical Xpress78

    国际 GLASS 研究追踪 IDH 突变胶质瘤复发时的基因组变化

    Jackson Laboratory、耶鲁大学等 10 国合作团队在 Nature 发表 GLASS 联盟研究,对 183 例治疗前后配对取样的 IDH 突变胶质瘤进行分析,发现复发时少突胶质细胞瘤倾向获得新的生长驱动突变,星形细胞瘤则更常发生大规模染色体改变。

    推荐理由:GLASS 联盟对 183 例配对样本的分析显示,IDH 突变胶质瘤的两种亚型在复发时走的是不同的基因组演化路径。

  1. 中国科学院遗传与发育生物学研究所65

    高彩霞与陈宇航团队在 Nature Plants 提出结构设计与表达调控协同的等位基因设计策略

    中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞团队与陈宇航团队在 Nature Plants 在线发表研究,提出结构指导设计与顺式调控优化相结合的等位基因工程策略,创制了除草剂抗性提升的水稻和小麦新种质。

    推荐理由:该工作把蛋白结构指导的编码区变异与顺式调控元件整合结合,在水稻和小麦中同时改造 HPPD,为复杂农艺性状改良提供可迁移路径。

  1. Nature Biotechnology78

    配体导向脂质纳米颗粒在体内生成 CAR NK 细胞

    研究团队开发了靶向 NK 细胞的脂质纳米颗粒 NtLNPs,用工程化双靶向 NK 细胞配体驱动受体特异性摄取和 mRNA 递送,在小鼠中实现最高约 80% 的 NK 细胞转染且脱靶效应很小。经系统给药递送 CAR mRNA 可在体内生成 CAR NK 细胞:靶向 CD19 的 CAR NK 细胞在健康小鼠中完全清除循环 B 细胞,靶向 CD3 的 CAR NK 细胞在自身免疫性肝炎模型中清除几乎全部自身反应性 T 细胞,作者据此提出其在 T 细胞驱动疾病上可能优于 CAR T 疗法。

    推荐理由:研究用双靶向配体修饰的 LNP 在小鼠体内直接生成 CAR NK 细胞,为体内细胞工程提供了可迁移的递送思路。

  2. Nature Genetics78

    人类胰腺导管腺癌克隆异质性及其对肿瘤进展的影响

    研究对 62 例原发胰腺导管腺癌肿瘤进行单细胞 RNA 测序(443,451 个细胞),并对其中 11 例做匹配的空间转录组(53,236 个 spot),刻画克隆、转录与空间多样性。分析发现肿瘤内存在多个遗传上不同的恶性克隆,配体-受体程序受基因组剂量调控,8q24(MYC)扩增与谱系内经典向基底样转变反复相关;小鼠与原代人模型中的 MYC 敲低可重新激活经典程序并恢复免疫应答通路。

    推荐理由:62 例原发肿瘤的单细胞与空间转录组图谱显示,8q24 的 MYC 扩增与肿瘤谱系内经典向基底样转变相关,为理解 PDAC 克隆异质性提供了资源。

  1. 公众号:北大生科67

    昌增益研究组揭示NH₄⁺与HCO₃⁻协同耗竭ATP触发细菌休眠并驱动蛋白质相分离

    北京大学昌增益团队在Scientific Reports发表研究,提出细菌休眠由氨基酸氧化副产物NH₄⁺与HCO₃⁻协同触发,而非营养耗尽本身。两种代谢物同时存在时才会显著降低ATP水平,解除ATP对FtsZ、FtsA、MinD、AdhE、RplA等蛋白的增溶保护,使其以折叠态相分离组装成复苏延迟体;补充ATP可完全溶解凝聚体并恢复生长。

    推荐理由:该研究把细菌休眠的触发从营养饥饿转向NH₄⁺与HCO₃⁻协同耗竭ATP,为理解持留与抗生素耐受提供新框架。

  2. Nature Genetics72

    微核中的 ecDNA 限制肿瘤细胞适合度并与患者较好生存相关

    研究发现 ecDNA 是微核的重要来源,复制压力下 ecDNA 发生有丝分裂聚集、不对称分配和错分进入微核,携带 ecDNA^+ 微核的细胞增殖能力下降、更易死亡。单微核测序显示多个不同 ecDNA 种类会汇聚到同一微核中;在 MYCN 扩增的神经母细胞瘤患者中,诊断时 ecDNA^+ 微核频率较高与总生存期改善相关。作者据此提出有丝分裂期 ecDNA 滞留可能成为治疗切入点。

    推荐理由:研究把 ecDNA 的微核错分与适合度下降联系起来,并给出神经母细胞瘤患者生存关联,为理解 ecDNA 的代价提供新角度。

  1. 科学网78

    石磊团队揭示CCNB1IP1调控序列演进驱动灵长类大脑皮层扩张

    中国科学院昆明动物研究所石磊团队联合国际同行,鉴定出古老保守基因CCNB1IP1在灵长类大脑中表达逐步升高,通过降解细胞周期相关转录因子促进基底祖细胞增殖,参与推动皮层扩张,成果发表于《自然·遗传学》。

    推荐理由:研究把皮层扩张的线索指向古老基因CCNB1IP1的顺式调控元件演进,而非人类特有新基因。

  1. Google Health Blog72

    Google 与 BIDMC 在《柳叶刀》发表 AMIE 诊断 AI 真实门诊研究

    Google 与 Beth Israel Deaconess Medical Center(BIDMC)在《柳叶刀》发表 AMIE 诊断 AI 聊天机器人真实门诊研究,98 例患者在就诊前先与 AMIE 对话,监督医生实时监控,没有一次对话因预设安全标准被中断。

    推荐理由:在真实门诊中,98 例患者先与诊断 AI 对话,医生实时监督,结果无一次因安全标准被中断,可对照 AI 问诊的落地边界。

  1. Biohub78

    Biohub 用 AI 揭示肿瘤细胞状态异质性,预测联合用药延长 DMG 小鼠生存

    Biohub 与哥伦比亚大学等机构合作在 Nature Genetics 发表两篇论文,提出“cancer quantum biology”假说:同类型肿瘤在患者间拥有几乎相同的恶性细胞状态集合,这些状态可相互转换从而逃避单靶点药物。

    推荐理由:两篇 Nature Genetics 论文提出肿瘤细胞状态在患者间高度保守,并用 AI 预测针对多状态的联合用药,在 DMG 小鼠模型中延长生存。

  1. Quaid Morris78

    Codebook Project 在 Nature 发布 300 多个未表征人类转录因子的 DNA 结合基序

    Codebook Project 这项国际合作在 Nature 发布结果,为 300 多个此前未表征的人类转录因子(TF)鉴定了准确的 DNA 结合基序和基因组结合位点。论文链接为 https://www.nature.com/articles/s41586-026-10798-9。

    推荐理由:这项国际合作给出了 300 多个此前未表征的人类转录因子的 DNA 结合基序与基因组结合位点,可供做调控基因组分析的读者参考。

已经到底了