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  1. Seurat:GitHub Releases72

    Seurat v5.6.0 发布,新增线程控制并加速核心分析步骤

    Seurat 发布 v5.6.0,新增 setThreads 和 getThreads 控制支持的 C++ 内核与 uwot UMAP 后端线程。

    推荐理由:新版本把归一化、降维、聚类和整合等常用步骤改为多线程 C++ 实现,并修复了 BPCells 磁盘型数据的打分问题,做单细胞分析的读者可据此判断是否升级。

  1. AlphaFold 3:GitHub Releases78

    AlphaFold 3 发布 v3.0.3,代码许可证改为 Apache 2.0

    AlphaFold 3 发布 v3.0.3,代码许可证从 CC BY-NC-SA 4.0 改为 Apache 2.0,并兼容 Python 3.14。该版本还带来性能改进:Confidences JSON 序列化最高提速 30 倍,5000 残基输入的序列化时间从 43 s 降至 1.3 s,mmCIF 解析提速 4%。

    推荐理由:许可证从非商用协议改为 Apache 2.0,并给出大输入序列化提速的具体数字,可据此判断能否商用与升级。

已经到底了