模拟揭示DDX3X不依赖ATP解链dsRNA机制

Kang Wang等研究团队在PLOS Computational Biology发表研究，用基于物理的粗粒化RNA模型并加入DDX3X与dsRNA的弱特异性相互作用，模拟DDX3X不依赖ATP解开dsRNA的过程。结果显示解链事件具有内在随机性，需越过一个能垒，热涨落与熵增提供RNA重塑驱动力，解链通过罕见但必需的链置换中间态完成。 作者结合深度学习辅助分析对不同熵组分贡献排序，称氢键作用占主导，其次是碱基堆积，再次是骨架构象。该研究提出一种此前未被认识的RNA双链解链物理机制，并为研究RNA重塑动力学提供框架。 研究背景是近期实验显示部分DDX蛋白在无ATP时也能促进dsRNA解链，其物理机制此前不明。

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