E-GADGETS遗传算法检测高阶基因-环境交互

研究团队开发了遗传算法 E-GADGETS，用于在病例-父母三联体数据中搜索多个 SNP 与非遗传暴露因素之间的高阶交互（G×G×E），并已发表。模拟显示，在 1 万或 5 万个候选 SNP 中，E-GADGETS 能识别涉及 3 或 4 个 SNP 及分类或连续暴露的 G×G×E 交互，且优于将现有三联体上位性挖掘算法改造后用于二分类暴露和小候选 SNP 集的方案。 作者同时给出基于置换的推断流程和结果可视化方法。应用于公开病例-父母数据的候选 SNP 时，E-GADGETS 在亚洲人群中检出与母亲环境烟草烟雾暴露相关的交互信号，关联表型为单纯腭裂。

AI 根据报道生成 · 2 小时前更新

还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。