剪接与未剪接RNA联合表征提升单细胞信息量

研究团队提出将单细胞RNA-seq中的剪接（成熟）与未剪接（新生）转录本计数作为两类独立特征，而非合并为单一表达矩阵，以检验能否增加无监督降维可恢复的潜在结构。作者在四个数据集上对仅剪接、仅未剪接、相加和拼接四种表示分别做非负矩阵分解，并用交叉验证估计可揭示秩。 结果显示，拼接表示在四个数据集上均优于相加表示，并在其中三个上超过任一单模态输入，作者据此称保留剪接状态能暴露超出单模态及其加和的稳定潜在程序。剪接与未剪接来源的因子重叠很少，对应基因集富集分别指向稳态与新生调控活动。 作者发布了实现该方法的 singlet R 包及复现全部图表的代码。

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还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。