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DPA框架解析胃癌分期模块重连

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AI 综述

研究团队提出动态扰动分析(DPA)框架,用“扰动程度”指标量化疾病不同阶段分子互作网络的模块重连。以胃癌进展为模型,DPA发现肿瘤起始后阶段特异性转录变化有限,但广泛的模块重连持续存在,并识别出细胞外基质重塑、致癌信号激活、干性获得和晚期微环境适应等进展相关扰动程序。 扰动分析给出两个主要疾病驱动程序,并优先锁定PTPN12和LINGO1等此前未被认识的调控因子,其功能在实验中得到验证。基于模块重连的药物重定位还发现PJ-34是靶向晚期疾病相关扰动的候选药物。作者称DPA可作为通用框架用于解析疾病进展。

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报道时间线

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10月19日
  1. Briefings in Bioinformatics
    DPA 框架通过模块重连解析胃癌分期进展并识别治疗脆弱点

    研究提出动态扰动分析(DPA)框架,用“扰动程度”这一新指标量化疾病不同阶段分子互作网络的模块重连。以胃癌进展为模型,DPA 发现肿瘤起始后阶段特异性转录变化有限,但广泛的模块重连持续存在,并识别出细胞外基质重塑、致癌信号激活、干性获得和晚期微环境适应等进展相关扰动程序。扰动分析给出两个主要疾病驱动程序,并优先锁定 PTPN12 和 LINGO1 等此前未被认识的调控因子,其功能在实验中得到验证。基于模块重连的药物重定位还发现 PJ-34 是靶向晚期疾病相关扰动的候选药物。作者称 DPA 可作为通用框架用于解析疾病进展。

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