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AI框架扩展人类胆汁酸图谱

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AI 综述

贾伟团队在 Cell Metabolism 发表研究,建立 AI 驱动的胆汁酸发现框架,扩展了人类胆汁酸图谱。团队开发基于 transformer 架构的分子语言模型 MetLLM,先在 HMDB 二十余万个代谢物结构上预训练,再用已知胆汁酸分子精调,用于给候选分子打分;从超过 52 万个含胆汁酸样四环骨架的结构中筛出 3,900 个优先候选类似物,构成候选地图 MetSpace。 研究对健康志愿者粪便样本做液相色谱-高分辨质谱分析,在人类粪便中匹配到 144 个 MetSpace 胆汁酸相关化合物;团队选择结构已确认的 MS2141 进行生物评价。

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10月28日
  1. 公众号:BioArt精选
    贾伟团队在Cell Metabolism发表AI驱动胆汁酸发现框架,扩展人类胆汁酸图谱

    贾伟教授团队在Cell Metabolism发表研究,建立AI驱动的胆汁酸发现框架,重新扩展了人类胆汁酸图谱。团队开发基于transformer架构的分子语言模型MetLLM,先在HMDB二十余万个代谢物结构上预训练,再用已知胆汁酸分子精调,用于给候选分子打分;结合生物活性分子、天然产物、胆汁酸药物类似物和AI生成分子,从超过52万个含胆汁酸样四环骨架的结构中筛出3,900个优先候选类似物,构成候选地图MetSpace。

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