血液代谢组数据重分析与开源工具发布
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血液代谢组数据重分析与开源工具发布
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AI 综述
研究团队对 Metabolomics Workbench 中所有使用 Orbitrap 或 QTOF 质谱的人体血液代谢组研究做了基于元数据的系统重分析,共纳入 44 165 个样本,并据此开发了开源软件,作者称该软件可对 Workbench 数据中任意代谢物做类似分析。 作者用 PubChem 标识符统一代谢物、以 SMILES 表示做嵌入,构建了含 6752 个血液代谢物、25 个结构簇的图谱。在至少 10 项研究中检测到的 337 120 对代谢物中,结构相关簇的丰度呈相关(ρ 最高 0.6);已知临床生物标志物之间也出现候选代谢关联,部分 ρ > 0.7。这些关联为候选结果,尚非已验证的生物学结论。
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最新进展10月19日 12:48
Metabolomics Workbench 血液代谢组数据重分析:代谢物类别、生物标志物与药物的关联报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月19日
- Briefings in Bioinformatics精选Metabolomics Workbench 血液代谢组数据重分析:代谢物类别、生物标志物与药物的关联
研究团队对 Metabolomics Workbench 中所有使用 Orbitrap 或 QTOF 质谱的人体血液代谢组研究做了基于元数据的系统重分析,共纳入 44 165 个样本。作者用 PubChem 标识符统一代谢物、以 SMILES 表示做嵌入,构建了包含 6752 个血液代谢物、25 个结构簇的图谱,并分析这些簇与生物标志物、药物之间的相关性。在至少 10 项研究中检测到的 337 120 对代谢物中,结构相关的簇丰度呈相关(ρ 最高 0.6);已知临床生物标志物之间也出现候选代谢关联,部分 ρ > 0.7。
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还没有足够的连续观测数据,暂不绘制趋势。