scDIG：单细胞数据交互式密度门控Shiny工具
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scDIG：单细胞数据交互式密度门控Shiny工具
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AI 综述
scDIG 作者团队发布了一个基于 R Shiny 的应用 scDIG，让研究者能在 scRNA-seq 与 CITE-seq 数据的二维投影中直接定义细胞群体。该工具整合了双峰指数驱动的特征选择、特征加权核密度估计和交互式等高线门控。 在心血管评估弗吉尼亚（CAVA）队列受试者的 CITE-seq PBMC 数据上，作者报告 scDIG 在连续嵌入中解析出常规聚类难以捕捉的转录上不同的 CD4⁺ T 细胞亚群，并基于 RNA 表达识别出 GZMB 富集的细胞毒性淋巴细胞亚群；敏感性分析称所定义的门控对应高维特征空间中一致的细胞群体。 该应用非商业用途免费开放，源代码已公开。
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最新进展10月22日 08:00
scDIG：用于单细胞蛋白组与转录组数据交互式密度门控的 R Shiny 应用报道时间线
沿着报道，了解事件的不同侧面。
10月22日
- BMC BioinformaticsscDIG：用于单细胞蛋白组与转录组数据交互式密度门控的 R Shiny 应用
scDIG 是一个基于 Shiny 的 R 应用，可在 scRNA-seq 与 CITE-seq 数据的二维投影中直接定义细胞群体。该工具整合了双峰指数驱动的特征选择、特征加权核密度估计和交互式等高线门控。在心血管评估弗吉尼亚（CAVA）队列受试者的 CITE-seq PBMC 数据上，scDIG 在连续嵌入中解析出常规聚类难以捕捉的转录上不同的 CD4⁺ T 细胞亚群，并基于 RNA 表达数据识别出 GZMB 富集的细胞毒性淋巴细胞亚群。敏感性分析确认所定义的门控对应高维特征空间中一致的细胞群体。该应用非商业用途免费开放，源代码已公开。
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