iGPSC-DB单细胞遗传扰动推断数据库发布

哈尔滨医科大学团队在 Nucleic Acids Research 发布 iGPSC-DB 数据库，用于推断肿瘤微环境细胞与遗传扰动事件的关联、解析细胞对扰动的异质性响应。该库整理了 178 114 个靶向 7407 个基因的扰动事件，与来自 1580 个样本、88 种癌症类型的 9 249 080 个单细胞的关联。 数据库提供七项检索与分析工具，覆盖扰动事件与细胞及细胞类型的推断关联、扰动对细胞功能、发育轨迹和细胞间通讯的影响、不同扰动的组合效应、扰动对恶性细胞分化轨迹与功能状态的影响，以及扰动靶基因与临床生存结局的关联。作者称其可支持单细胞分辨率的基因功能、调控机制研究与肿瘤治疗靶点发现。

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还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。