TriTower-m6Am:三塔架构预测m6Am位点
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TriTower-m6Am:三塔架构预测m6Am位点
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AI 综述
Kaifeng Xiong 等人提出并评估了 TriTower-m6Am,这是一个融合语义、序列与结构三类表示的 mRNA m6Am 位点预测模型。在 640 条序列的独立测试集上,该模型取得 AUC 0.776、MCC 0.425,优于 DTC-m6Am 的 AUC 0.765、MCC 0.411,且可训练参数少 4.4 倍。 三塔分别采用预训练 RNA 基础模型 RNA-FM 配合 BellPooling、One-Hot BiLSTM,以及基于 41-nt 窗口的关系图卷积网络 RGCN。在 0.40 至 0.70 的每个匹配特异度下,它从 320 个真实位点中多召回 1–7 个。 作者称,三塔模式能否迁移到其他 RNA 修饰预测任务,仍有待后续检验。
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最新进展11月5日 22:00
TriTower-m6Am:融合语义、序列与结构信息的三塔异构深度学习架构用于 mRNA m6Am 位点预测报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月5日
- PLOS Computational BiologyTriTower-m6Am:融合语义、序列与结构信息的三塔异构深度学习架构用于 mRNA m6Am 位点预测
TriTower-m6Am 用语义、序列与结构三塔异构架构预测 mRNA 的 m6Am 位点,在 640 条序列的独立测试集上取得 AUC 0.776、MCC 0.425,优于 DTC-m6Am 的 AUC 0.765、MCC 0.411,且可训练参数少 4.4 倍。三塔分别采用预训练 RNA 基础模型 RNA-FM 配合 BellPooling、One-Hot BiLSTM 和基于 41-nt 窗口的关系图卷积网络 RGCN。在 0.40 至 0.70 的每个匹配特异度下,它从 320 个真实位点中多召回 1–7 个。
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