DMS-MaP框架在细胞内定量RNA结构与蛋白占据
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DMS-MaP框架在细胞内定量RNA结构与蛋白占据
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AI 综述
《Nucleic Acids Research》论文作者建立了一套基于DMS突变谱测序（DMS-MaP）的定量框架，可在人类细胞中以单核苷酸分辨率同时测量RNA结构与RNA结合蛋白（RBP）的结合。 作者将该框架应用于含1600个成员的MS2发夹文库，使用MS2–MCP系统，发现RNA折叠是MS2 coat protein（MCP）识别的最强决定因素：需要形成稳定发夹和共有环序列，茎长或GC含量主要通过影响发夹折叠起作用。 上述结论来自该论文在人类细胞中对MS2–MCP体系的测量，是否适用于其他RBP与RNA序列尚未涉及。
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最新进展10月30日 16:46
DMS 结构探针在人类细胞中量化 RNA 发夹上的蛋白占据并关联功能报道时间线
沿着报道，了解事件的不同侧面。
10月30日
- Nucleic Acids ResearchDMS 结构探针在人类细胞中量化 RNA 发夹上的蛋白占据并关联功能
研究建立了一套基于 dimethyl sulfate 突变谱测序（DMS-MaP）的定量框架，可在人类细胞中以单核苷酸分辨率同时测量 RNA 结构与 RNA 结合蛋白（RBP）的结合。作者将该方法应用于含 1600 个成员的 MS2 发夹文库，发现 RNA 折叠是 MS2 coat protein（MCP）识别的最强决定因素，需要形成稳定发夹和共有环序列，茎长或 GC 含量主要通过影响发夹折叠起作用。
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