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Cell3D单细胞与空间组学数据库发布

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AI 综述

Cell3D研究团队在《Nucleic Acids Research》发布Cell3D数据库,用于单细胞与空间转录组数据的整合探索、3D交互可视化和crosstalk分析。数据库收录898个公开数据集,其中单细胞397个、空间转录组501个,覆盖11个物种、105种疾病、756种细胞类型和83个器官/组织,共2,924,646个单细胞和空间spot。 数据库整合12个主流功能注释系统,用户可从基因表达、细胞聚类到通路活性和临床表型多个层级查看数据。据该研究团队介绍,数据库可通过 https://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/Cell3D 免费访问。

AI 根据报道生成 · 1 天前更新

报道时间线

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10月27日
  1. Nucleic Acids Research
    Cell3D 数据库发布,支持单细胞与空间组学的 3D 交互可视化和 crosstalk 分析

    Cell3D 是一个可免费访问的交互式数据库,用于单细胞与空间转录组数据的整合探索、3D 可视化和 crosstalk 分析。它收录 898 个公开数据集,其中单细胞 397 个、空间转录组 501 个,覆盖 11 个物种、105 种疾病、756 种细胞类型和 83 个器官/组织,共 2 924 646 个单细胞和空间 spot。数据库整合 12 个主流功能注释系统,用户可从基因表达、细胞聚类到通路活性和临床表型多个层级查看数据。

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