UcTCRp：仅用TCRβ识别MAIT与iNKT信号

《Briefings in Bioinformatics》论文作者提出并发布 UcTCRp，一个仅依赖 TCRβ 序列、在免疫组库中检测和刻画 MAIT 与 iNKT 相关信号的框架。 研究从已收集的人和小鼠 MAIT、iNKT TCRβ 序列中提取 V 基因使用偏好和可重复的 CDR3β 氨基酸组成等判别特征，再以分别在大型人、小鼠 TCRβ 组库上预训练的物种特异性 transformer 表示整合这些特征，并用各物种整理的 MAIT、iNKT 和常规 T 细胞参考做独立监督建模。作者称，所得物种特异性模型在独立人、小鼠队列中表现稳健。 在配对的 scRNA-seq/scTCR-seq 数据中，UcTCRp 找回了转录组定义的 MAIT 和 iNKT 细胞，并识别出有受体证据支持、但仅靠表达注释漏掉的 MAIT 样候选细胞；通过配对单细胞参考和合成 spike-in 实验进行 bulk 校准，确立了组库水平丰度估计的操作特性。

AI 根据报道生成 · 2 小时前更新

还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。