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EvoNiche肿瘤生态位时空数据库发布

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AI 综述

EvoNiche研究团队发布肿瘤生态位时空动态数据库EvoNiche,整合91套配对的空间与单细胞转录组数据集,覆盖35种癌症类型,用于系统解析肿瘤生态系统的区域动态与时空模式。 据论文描述,该库包含712张组织切片、1,953,708个空间spot,以及58个单细胞数据集共2,945,536个细胞;团队据此识别出5609个空间生态位,并重建组织水平和细胞水平的时空轨迹。数据库可通过 bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/EvoNiche 或 evoniche.bio-database.com 访问。

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报道时间线

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10月19日
  1. Nucleic Acids Research
    EvoNiche 数据库发布,整合 91 套空间与单细胞转录组数据解析肿瘤生态位

    EvoNiche 数据库发布,整合 91 套配对的空间与单细胞转录组数据集,覆盖 35 种癌症类型。数据库包含 712 张组织切片、1 953 708 个空间 spot 和 58 个单细胞数据集共 2 945 536 个细胞,识别出 5609 个空间生态位,并重建组织水平和细胞水平的时空轨迹。

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