刘永鑫组发表水果微生物组综述

中国农科院深圳基因组所刘永鑫组联合格拉茨技术大学 Gabriele Berg 等，在 aBIOTECH 发表水果微生物组综述，梳理该领域从描述性分析走向功能理解与应用的方法框架。 综述指出，水果样本普遍存在微生物生物量低、宿主 DNA 污染高、元数据标准分散和水果专属参考资源有限等问题，并提出互补路径：扩增子测序做大规模群落表征，鸟枪法宏基因组测序推断功能潜力并重建 MAGs，培养组学获取活菌株，代谢组学关联生化性状，功能实验检验因果。 综述同时提醒，分离菌株的性质不等同于完整水果微生物组的作用；在肠道宏基因组中检测到食物相关微生物，也不能证明其稳定定殖、功能活性或健康获益。

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还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。