机器学习模型预测铁配合物穆斯堡尔性质
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机器学习模型预测铁配合物穆斯堡尔性质
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AI 综述
《Journal of Chemical Information and Modeling》研究团队发表基于 Chemprop 的深度学习模型,用 522 个化合物的精选实验数据训练,预测含铁分子配合物与蛋白模型的穆斯堡尔同质异能位移(IS)和四极分裂(QS)。在测试集上,IS 和 QS 的 R² 分别为 0.92 和 0.73;在全数据集上分别为 0.98 和 0.91。 该模型未使用任何蛋白数据训练,但对 heme 与非 heme 蛋白中多个铁位点及第一、第二配位层模型的预测,复现了此前与实验高度吻合的 DFT 结构预测。相比相同几何构型下的 DFT 计算,该方法将计算时间缩短 218 倍。研究团队称,这是首个针对分子铁配合物穆斯堡尔数据的机器学习工作,有望用于大规模铁配合物与铁蛋白结合位点结构的快速筛选。
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最新进展10月29日 12:01
机器学习预测含铁分子配合物与蛋白模型的实验穆斯堡尔谱性质报道时间线
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10月29日
- Journal of Chemical Information and Modeling机器学习预测含铁分子配合物与蛋白模型的实验穆斯堡尔谱性质
基于 522 个化合物的精选实验数据集,深度学习模型 Chemprop 在测试集上对同质异能位移(IS)和四极分裂(QS)的 R² 分别达到 0.92 和 0.73,在全数据集上为 0.98 和 0.91。该模型对 heme 与非 heme 蛋白中多个铁位点及第一、第二配位层模型的预测复现了此前与实验高度吻合的 DFT 结构预测,尽管训练中未使用任何蛋白数据。相比相同几何构型下的 DFT 计算,该方法将计算时间缩短 218 倍。这是首个针对分子铁配合物穆斯堡尔数据的机器学习工作,有望用于大规模铁配合物与铁蛋白结合位点结构的快速筛选。
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