模拟揭示MmpL3质子化驱动构象变化

Lixinhao Yang等人在《PLOS Computational Biology》发表分子动力学模拟研究，提出耻垢分枝杆菌MmpL3中保守Asp-Tyr二联体的质子化状态调控其构象与底物结合口袋的开合。 模拟显示，Asp256质子化诱导二联体开放构象、提高局部水可及性，使周质结合口袋趋于更开放；Asp645质子化则稳定闭合构象、降低水可及性并收窄跨膜结合口袋。作者据此提出顺序质子化模型，认为质子化依赖的构象变化与底物转运发生变构偶联。 MmpL3负责转运海藻糖单分枝菌酸酯（TMM）等细胞壁前体，是结核分枝杆菌的潜在治疗靶点。上述结论来自模拟，尚未经实验验证。

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还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。