XYcellAtlas泛癌性别差异与Y染色体丢失图谱数据库发布
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XYcellAtlas泛癌性别差异与Y染色体丢失图谱数据库发布
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AI 综述
XYcellAtlas研究团队在 Nucleic Acids Research 发布 XYcellAtlas 数据库,用于整合并多维可视化人体组织在单细胞转录组、表观组和空间转录组层面的性别差异与 Y 染色体丢失(LOY)特征。 该资源汇总 6764 例患者样本,覆盖 18 种癌症类型、8 种癌前病变和 21 种组织来源,包含超过 2580 万个单细胞和 100 万个空间转录组 spot。研究团队称,其用在正常组织数据集上训练的随机森林分类器量化各细胞类型的 LOY 频率,并收录性别偏向和 LOY 相关的差异表达基因、染色质峰、核心转录因子及功能注释,以及恶性细胞和肿瘤微环境中的失调特征。
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最新进展10月30日 16:19
XYcellAtlas 发布跨癌种单细胞与空间组学的性别差异及 Y 染色体丢失图谱报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月30日
- Nucleic Acids ResearchXYcellAtlas 发布跨癌种单细胞与空间组学的性别差异及 Y 染色体丢失图谱
XYcellAtlas 是一个整合并多维可视化人体组织性别差异与 Y 染色体丢失(LOY)特征的数据库,覆盖单细胞转录组、表观组和空间转录组数据。该资源汇总了 6764 例患者样本,涵盖 18 种癌症类型、8 种癌前病变和 21 种组织来源,包含超过 2580 万个单细胞和 100 万个空间转录组 spot。研究利用在正常组织数据集上训练的随机森林分类器,量化各细胞类型的 LOY 频率,并系统收录性别偏向和 LOY 相关的分子改变,包括差异表达基因、染色质峰、核心转录因子及其功能注释,以及恶性细胞和肿瘤微环境中的失调特征。
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