八种空间转录组反卷积方法对细胞类型缺失的稳健性评估

一项发表于 Briefings in Bioinformatics 的研究用两个参考数据集做大量模拟，系统评估了 8 种反卷积方法在参考数据缺失细胞类型时的稳健性，涉及面向空间转录组的 CARD、cell2location、RCTD、Seurat、SPOTlight、Stereoscope，以及面向 bulk RNA-seq 的 MuSiC、SCDC。 研究称，在无细胞类型缺失的基线条件下，cell2location 表现最好，Seurat 最差；缺失细胞类型越多，各方法性能按比例下降，且相对降幅相近，没有哪种方法对细胞类型错配更稳健。

AI 根据报道生成 · 1 小时前更新

还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。