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Ribotools 工具集发布，可联合 Rp-Bp 分析翻译组

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AI 综述

NAR Genomics and Bioinformatics 作者团队发布 Ribotools 工具集，用于分析配对的核糖体印迹测序（Ribo-seq）与 RNA 测序数据，可独立使用，也可与 Rp-Bp 联用，完成 Ribo-seq 质控、开放阅读框发现、翻译效率和差异表达分析。Ribotools 与 Rp-Bp 均可在 Bioconda 获取。作者用 Ribotools 刻画人诱导多能干细胞（hiPSCs）向心肌细胞分化的过程，观察到细胞从可塑的、信号驱动状态向稳定的、结构定型状态转变，并称这一转变由多层翻译调控分阶段推进。结合蛋白质组学，该数据集被作者定位为研究 hiPSC 心脏谱系定向的多组学资源。作者同时给出了一套可复现、可扩展的流程，用于基准评测翻译效率分析工具。

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11月3日

17:37
NAR Genomics and Bioinformatics
Ribotools 工具集发布，联合 Rp-Bp 分析 Ribo-seq 与 RNA-seq 翻译组数据
Ribotools 工具集发布，用于分析配对的核糖体印迹测序（Ribo-seq）与 RNA 测序数据，可独立使用，也可与 Rp-Bp 联用，完成 Ribo-seq 质控、开放阅读框发现、翻译效率和差异表达分析。作者用 Ribotools 刻画人诱导多能干细胞（hiPSCs）向心肌细胞分化的过程，观察到细胞从可塑的、信号驱动状态向稳定的、结构定型状态转变，这一转变由多层翻译调控分阶段推进。结合蛋白质组学，该数据集为研究 hiPSC 心脏谱系定向提供了多组学资源。作者还给出了一套可复现、可扩展的流程，用于基准评测翻译效率分析工具。

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