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樊嘉团队绘制结直肠癌肝转移免疫图谱并锁定TREM2⁺巨噬细胞

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AI 综述

复旦大学附属中山医院樊嘉院士和杨欣荣教授团队在Cancer Letters发表研究,整合CyTOF、单细胞转录组、空间转录组、Bulk RNA-seq及脂质组等多组学数据,鉴定出在结直肠癌肝转移灶中富集的TREM2⁺脂滴富集巨噬细胞。 研究纳入12例患者的CyTOF数据、21例Bulk RNA-seq、4例患者6份组织的scRNA-seq(质控后53,867个细胞,其中20,762个髓系细胞二次聚类得到11个亚群)及200例临床组织样本,发现肝转移灶中巨噬细胞和Treg细胞富集、CD8⁺ T细胞耗竭。 团队称,结合小鼠肝转移模型和12例患者来源的离体肿瘤模型,靶向TREM2或抑制白三烯合成可增强抗PD-1治疗的抗肿瘤效果,提示该通路具有潜在治疗价值。

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10月30日
  1. 公众号:生信人
    樊嘉院士团队在Cancer Letters发表结直肠癌肝转移免疫图谱,鉴定TREM2⁺脂滴富集巨噬细胞

    复旦大学附属中山医院樊嘉院士和杨欣荣教授团队在Cancer Letters发表研究,整合CyTOF、单细胞转录组、空间转录组、Bulk RNA-seq及脂质组等多组学数据,鉴定出在结直肠癌肝转移灶中富集的TREM2⁺脂滴富集巨噬细胞。研究纳入12例患者的CyTOF数据、21例Bulk RNA-seq、4例患者6份组织的scRNA-seq(质控后53,867个细胞,其中20,762个髓系细胞二次聚类得到11个亚群)及200例临床组织样本,发现肝转移灶中巨噬细胞和Treg细胞富集、CD8⁺ T细胞耗竭。

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