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ENflorA:批量提交测序数据至ENA的脚本工具

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先了解这件事

AI 综述

BMC Bioinformatics 论文作者发布了一套名为 ENflorA 的脚本工具,用于将样本、测序读段和带注释的组装数据以简单、标准化的方式批量提交至 European Nucleotide Archive(ENA)。作者称,该工具支持通过电子表格录入元数据,适合批量上传不同来源的数据,并可完整集成进生物信息学流程。 作者还称,ENflorA 平台无关,可在高性能计算机上原生运行,并内置 lftp 大文件上传选项和测试上传选项。这些是论文作者对工具功能的描述,报道未给出独立验证的使用效果。

AI 根据报道生成 · 2 小时前更新

报道时间线

沿着报道,了解事件的不同侧面。

10月21日
  1. BMC Bioinformatics
    ENflorA:面向 European Nucleotide Archive 的下一代测序数据批量提交工具

    ENflorA 是一套可将样本、测序读段和(带注释的)组装数据以简单、标准化方式批量提交至 European Nucleotide Archive(ENA)的脚本工具。它支持通过电子表格录入元数据,适合批量上传来自不同来源的数据,并可完整集成进生物信息学流程。该工具平台无关,可在高性能计算机上原生运行,内置 lftp 大文件上传选项和测试上传选项。通过简化 ENA 提交流程,ENflorA 有助于提升高通量测序数据的可发现性、可访问性、互操作性和可复用性。

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还没有足够的连续观测数据,暂不绘制趋势。