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厌氧产氢菌靶向高通量分选方法发表

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AI 综述

哈尔滨工业大学(深圳)任南琪、中国科学院天津工业生物技术研究所黄聪等人在 iMeta 在线发表论文,提出“功能识别优先、靶向高通量分选”策略,用于挖掘厌氧产氢功能微生物。研究对 12 个规模化沼气工程样本做 16S rRNA 基因测序与宏基因组分析,获得 281 个完成性高于 70%、污染率低于 10% 的 MAGs,并依据 FDH、AK、BK 三个产氢关键酶基因识别出 215 个潜在产氢菌株。 研究称,据此成功分选出 81 株潜在厌氧产氢菌株,目标菌株获得率可达 37%,菌株成活率在 70% 以上。论文同时指出,当前高通量分选技术主要依赖单细胞分离原理,难以同步分离具有物理聚集特征和功能互作关系的微生物群落。 所有测序数据已提交至国家生物信息中心 GSA,登录号为 CRA029365。

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报道时间线

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10月20日
  1. 公众号:宏基因组
    任南琪院士团队黄聪组在 iMeta 发表厌氧产氢微生物靶向高通量分选方法

    哈尔滨工业大学(深圳)任南琪、中国科学院天津工业生物技术研究所黄聪等人在 iMeta 在线发表方法论文,提出“功能识别优先、靶向高通量分选”策略,用于厌氧产氢功能微生物的挖掘。研究对 12 个规模化沼气工程样本做 16S rRNA 基因测序与宏基因组分析,组装分箱获得 281 个完成性高于 70%、污染率低于 10% 的 MAGs,并依据 FDH、AK、BK 三个产氢关键酶基因识别出 215 个潜在产氢菌株。

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