SecAct从空间转录组推断分泌蛋白信号活性

Nature Methods 发表的一项研究提出 SecAct 方法：作者用 1258 份、覆盖 37 种癌症类型的空间转录组样本建立基因签名，据此推断 1170 种分泌蛋白的信号活性，并将该方法用于空间转录组 spot、单细胞和 bulk RNA 数据。 作者用两例子宫内膜癌患者抗 NTN1 治疗前后的样本检验活性变化方向，在肝癌 Visium 切片中用非负矩阵分解归纳空间活性模式，并在卵巢癌 36,335 个细胞中重建候选来源与接收群。两例患者仅用于检验模型方向性，不能据此推断该治疗在广泛人群中的疗效。 作者还分析了 54 个癌症免疫治疗队列、5174 名患者，称干预结果支持 LY86 在该模型中具有抗肿瘤作用，并提示存在非细胞自主效应。

AI 根据报道生成 · 30 分钟前更新

还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。