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scLong:10亿参数单细胞基础模型

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AI 综述

scLong 作者团队提出约 10 亿参数的单细胞基础模型 scLong,基于 48,024,242 个细胞预训练,可同时建模 27,874 个基因。预训练数据来自 CELLxGENE、Cell Blast 和 Human Cell Atlas 的公开单细胞转录组数据。 该团队同时指出模型的三项限制:十亿参数的训练和推理仍需大量算力,缺乏高性能基础设施的团队难以使用;模型依赖 Gene Ontology 中静态、预定义的基因关系,难以适应动态的基因互作和条件特异性调控变化;双编码器表现对高、低表达基因的划分阈值(4,096)较敏感,阈值选择不当可能在基因表达分布异常的细胞类型上得到次优表示。

AI 根据报道生成 · 2 小时前更新

报道时间线

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10月30日
  1. 公众号:生信菜鸟团
    scLong:约 10 亿参数、覆盖 27,874 个基因的单细胞基础模型

    生信菜鸟团介绍了一个名为 scLong 的单细胞基础模型,约 10 亿参数,基于 48,024,242 个细胞预训练,可同时建模 27,874 个基因。

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