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研究团队提出SHiMDA框架预测miRNA-疾病关联

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AI 综述

研究团队提出名为SHiMDA的图学习框架,用于在上下文异质生物医学图上预测miRNA与疾病的关联。该框架为直接关联和具有生物学意义的元路径分别构建独立视图,并对元路径实例做分段消息传递,以显式编码路径内部结构,而非把每条路径压缩成粗粒度的源–目标捷径;同时引入置信度加权排序损失和过平滑正则,以降低图扰动下的监督偏差与表示同质化。 据论文称,在基准数据集上的实验显示,SHiMDA在基础与上下文设置下均取得较强预测性能,并在对抗性边扰动和特征扰动下持续优于代表性state-of-the-art基线。

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报道时间线

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10月27日
  1. Briefings in Bioinformatics
    SHiMDA:面向 miRNA–疾病关联预测的多图学习元路径建模框架

    SHiMDA 是一个在上下文异质生物医学图上做 miRNA–疾病关联预测的图学习框架,通过为直接关联和具有生物学意义的元路径构建独立视图,并对元路径实例做分段消息传递,显式编码其内部结构而非把每条路径压缩成粗粒度的源–目标捷径。该框架还引入置信度加权排序损失和过平滑正则,以降低图扰动下的监督偏差与表示同质化。在基准数据集上的实验显示,SHiMDA 在基础与上下文设置下均取得较强预测性能,并在对抗性边扰动和特征扰动下持续优于代表性 state-of-the-art 基线。

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