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Hi-APEX实现无需过氧化氢的活体邻近标记

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AI 综述

清华大学药学院秦为课题组与中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所陈影课题组等合作,在 Nature Chemical Biology 发表研究,开发出无需外加过氧化氢的 APEX2 邻近标记方法 Hi-APEX,并在活体小鼠中完成标记。 该方法以带四嗪基团的苯酚探针 TP 为底物,由 APEX2 催化实现邻近标记,再经四嗪与反式环辛烯修饰生物素的生物正交点击反应接上标签,用于蛋白质与 RNA 的空间组学分析。研究称,TP 探针可商业获取,无需改造 APEX2 酶本身,也不需要光照激活。 在小鼠肿瘤移植模型中,团队完成了 mGPX4 邻近蛋白的标记与鉴定;在海马神经元中,团队通过腺相关病毒递送线粒体靶向 APEX2 并结合 TP 给药,开展了线粒体基质蛋白质组分析。研究团队表示,Hi-APEX 尚需在更多细胞类型和动物模型中得到验证。

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11月1日
  1. 公众号:BioArt精选
    秦为/陈影团队开发 Hi-APEX,实现无需外加过氧化氢的 APEX2 活体空间多组学

    清华大学药学院秦为课题组与中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所陈影课题组等合作,在 Nature Chemical Biology 发表研究,开发出无需外加过氧化氢的邻近标记方法 Hi-APEX,并在活体小鼠中完成标记。该方法用带四嗪基团的苯酚探针 TP 作为底物,由 APEX2 催化实现邻近标记,再通过四嗪与反式环辛烯修饰生物素的生物正交点击反应接上标签,用于蛋白质与 RNA 的空间组学分析。

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