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全球地衣宏基因组揭示共生体间水平基因转移

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AI 综述

研究团队基于六大洲 533 份地衣相关宏基因组,组装出 197 个高完整度真核宏基因组组装基因组(MAG),在约 160 万个预测基因中检出 1,882 个推定水平基因转移(HGT)获得基因(约 0.12%),多数源自细菌。 这些基因在共生伙伴间功能分化:真菌共生体(mycobiont)中富集细胞壁/膜/包膜生物合成、转录与防御机制相关功能;光合共生体(photobiont)中富集氨基酸转运与代谢、信号转导与翻译相关功能。 研究还检出 31 个推定的共生体间 HGT 获得基因,其中 16 个推断由真菌共生体转移至光合共生体,15 个方向相反。上述基因均为“推定”,尚未经实验验证。

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10月21日
  1. Nature Communications
    全球地衣宏基因组揭示共生体间水平基因转移与功能分化

    基于六大洲 533 份地衣相关宏基因组组装的 197 个高完整度真核宏基因组组装基因组(MAG),在约 160 万个预测基因中检出 1,882 个推定水平基因转移(HGT)获得基因(约 0.12%),多数源自细菌。这些基因在共生伙伴间呈现功能分化:真菌共生体(mycobiont)中富集细胞壁/膜/包膜生物合成、转录与防御机制相关功能,光合共生体(photobiont)中富集氨基酸转运与代谢、信号转导与翻译相关功能。

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