RETrace2实现单细胞双组学谱系追踪

1. 08:00
   Nature Communications

   RETrace2：用高突变同聚物做单细胞回顾性谱系追踪

   RETrace2 是一种单细胞双组学方法，可同时进行谱系追踪和细胞类型鉴定。研究显示高突变同聚物的信息量约为传统微卫星重复的两倍，作者通过靶向这类位点并改进标记覆盖度、降低同聚物读取与扩增的实验误差，在微卫星不稳定生物中实现估计分辨率少于五次细胞分裂的连续谱系追踪，同时从同一细胞获得稀疏甲基化谱用于细胞类型鉴定。方法在体外真值模型中完成验证，并在 Msh2 缺陷小鼠的脑、肾和肝中重建了多器官谱系树。

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