克隆树枚举算法与数据集分析

1. 20:41
   Bioinformatics Advances

   克隆树空间的枚举与探索：基于 Infinite Sites 与 k-Dollo 模型的理论分析与数据集生成

   研究设计了多种算法，用于枚举指定突变数量下不同类别的克隆树，并对 Infinite Sites Assumption 与 k-Dollo 两种突变获得模型下的四类克隆树做了理论分析。利用这些算法生成了多个数据集并分析所生成的树，发现了一些符合预期与出乎意料的模式。分析还将枚举数据集与两种常用模拟数据采样流程进行比较，显示二者对空间的采样方式不同。其中一个数据集显示，在突变数量较小时，线性树比分支树普遍得多。相关代码已公开。

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