STRAND亚细胞空间转录组数据库发布
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STRAND亚细胞空间转录组数据库发布
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AI 综述
研究团队发布亚细胞分辨率空间转录组数据库与分析平台 STRAND，用于自动采集、质量控制和解读这类数据。团队称其汇集 6 个主要平台的 35 个亚细胞分辨率数据集，覆盖人和小鼠 17 种组织类型，合计约 49 亿条转录本坐标。 在标准化数据之上，STRAND 提供细胞分割评估、细胞类型注释、RNA 定位与共定位模式注释及亚细胞区室推断的分析流程。团队称两个案例显示，该平台能在培养细胞系中识别已知 RNA 定位模式，并在心肌细胞中检出药物诱导的 RNA 重定位。 STRAND 已在 https://strand.phasep.pro 开放使用。
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最新进展10月30日 16:19
STRAND 数据库发布：整合亚细胞分辨率空间转录组数据与分析流程报道时间线
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10月30日
- Nucleic Acids ResearchSTRAND 数据库发布：整合亚细胞分辨率空间转录组数据与分析流程
STRAND 是一个面向亚细胞分辨率空间转录组数据的整理与分析平台，用于自动采集、质量控制和解读这类数据。研究团队通过 agent 辅助的整理流程，汇集了来自 6 个主要平台的 35 个亚细胞分辨率数据集，覆盖人和小鼠的 17 种组织类型，合计约 49 亿条转录本坐标。在标准化数据之上，STRAND 提供覆盖细胞分割评估、细胞类型注释、RNA 定位与共定位模式注释以及亚细胞区室推断的分析流程。两个案例显示，该平台能在培养细胞系中识别已知的 RNA 定位模式，并在心肌细胞中检出药物诱导的 RNA 重定位。STRAND 已在 https://strand.phasep.pro 开放使用。
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