LESS-PseU:语言模型增强的RNA假尿苷位点预测框架
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LESS-PseU:语言模型增强的RNA假尿苷位点预测框架
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AI 综述
LESS-PseU 作者团队提出一种融合 DNABERT2 嵌入与手工特征半堆叠的 RNA 假尿苷(Ψ)位点预测框架:以 one-hot、k-mer 和核苷酸化学性质特征构建三个初级学习器,将其预测概率与 DNABERT2 嵌入拼接后,由 Logistic Regression 元学习器完成多物种预测。 作者称,在泄漏感知交叉验证下,该模型在三个物种的训练集上得到验证;在人类、小鼠和酵母的独立测试集上,AUC 分别为 0.9069、0.8833 和 0.8820,均高于所比较的模型。 作者还称,在 m5C 和 m7G 基准上的额外评估提供了初步证据,表明该框架可能适用于其他 RNA 修饰预测任务。
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最新进展10月28日 10:01
LESS-PseU:融合 DNABERT2 嵌入与半堆叠框架的 RNA 假尿苷位点预测模型报道时间线
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10月28日
- Journal of Chemical Information and ModelingLESS-PseU:融合 DNABERT2 嵌入与半堆叠框架的 RNA 假尿苷位点预测模型
LESS-PseU 通过将 DNABERT2 嵌入与三类手工特征初级学习器的预测概率拼接,用 Logistic Regression 元学习器完成多物种 RNA 假尿苷(Ψ)位点预测。模型基于 one-hot、k-mer 和核苷酸化学性质特征构建三个初级学习器,并在泄漏感知交叉验证下于三个物种的训练集上验证。
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