单细胞水平鞭毛基因表达与生长速率正相关
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单细胞水平鞭毛基因表达与生长速率正相关
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AI 综述
一项发表于 eLife 的研究在单细胞水平发现,大肠杆菌鞭毛基因活性与生长速率升高相关,这与群体测量中鞭毛基因表达伴随生长减慢的经典结论方向相反。作者认为这一矛盾类似辛普森悖论:群体测量把单细胞数据不加区分地汇总,而逐细胞同时考察瞬时生长与基因表达时,关系方向发生反转。 作者将这一现象归因于失衡生长带来的短暂加速,暂时抵消了鞭毛合成的负担,可能来自细胞分裂时继承的生长因子盈余。在组成型启动子驱动荧光蛋白表达的合成系统中也观察到类似效应,作者据此称该关系具有普遍性。计算模型显示,亲代生长因子的继承可以解释这一表观矛盾,并构成单细胞中缓解非必需且高耗能基因短期成本的一般机制。
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最新进展10月28日 20:20
单细胞水平发现鞭毛基因表达与生长速率正相关,与群体测量结论相反报道时间线
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10月28日
- eLife单细胞水平发现鞭毛基因表达与生长速率正相关,与群体测量结论相反
研究在单细胞水平发现,大肠杆菌(Escherichia coli)鞭毛基因活性与生长速率升高相关,这与群体测量中鞭毛基因表达伴随生长减慢的经典结论相反。作者认为这一矛盾类似辛普森悖论,源于群体测量把单细胞数据不加区分地汇总,而逐细胞同时考察瞬时生长与基因表达时关系方向发生反转。作者将这一现象归因于失衡生长带来的短暂加速,暂时抵消了鞭毛合成的负担,可能来自细胞分裂时继承的生长因子盈余。在组成型启动子驱动荧光蛋白表达的合成系统中也观察到类似效应,说明该关系具有普遍性。计算模型显示,亲代生长因子的继承可以解释这一表观矛盾,并构成单细胞中缓解非必需且高耗能基因短期成本的一般机制。
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