AI 从头设计可识别并切割指定蛋白靶点的蛋白酶
David Baker 团队组合 RFdiffusion2 的 RFD2-MI、ProteinMPNN、EnhancedMPNN 和 AlphaFold 3 从头设计半胱氨酸蛋白酶与锌蛋白酶,两项结果分别发表于 Nature。
推荐理由:两篇 Nature 论文用 RFdiffusion2、ProteinMPNN 与 AlphaFold 3 组合从头设计蛋白酶,并给出实验验证的成功率与提速幅度。
David Baker 团队组合 RFdiffusion2 的 RFD2-MI、ProteinMPNN、EnhancedMPNN 和 AlphaFold 3 从头设计半胱氨酸蛋白酶与锌蛋白酶,两项结果分别发表于 Nature。
推荐理由:两篇 Nature 论文用 RFdiffusion2、ProteinMPNN 与 AlphaFold 3 组合从头设计蛋白酶,并给出实验验证的成功率与提速幅度。
北京大学昌增益团队在Scientific Reports发表研究,提出细菌休眠由氨基酸氧化副产物NH₄⁺与HCO₃⁻协同触发,而非营养耗尽本身。两种代谢物同时存在时才会显著降低ATP水平,解除ATP对FtsZ、FtsA、MinD、AdhE、RplA等蛋白的增溶保护,使其以折叠态相分离组装成复苏延迟体;补充ATP可完全溶解凝聚体并恢复生长。
推荐理由:该研究把细菌休眠的触发从营养饥饿转向NH₄⁺与HCO₃⁻协同耗竭ATP,为理解持留与抗生素耐受提供新框架。