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傅静远团队在 Nature 发表肠道微生物 SNV 与健康及环境暴露的关联图景
Nature | 傅静远/王道明等绘制肠菌与人类健康和环境暴露单碱基尺度关联图景
AI 导读
荷兰格罗宁根大学医学中心傅静远团队在 Nature 发表研究,对肠道微生物单核苷酸变异开展大规模表型组关联研究(PheWAS)。研究整合荷兰和坦桑尼亚六个人群队列、10,781 名参与者和 11,831 份粪便宏基因组样本,检测约 1280 万个常见肠道微生物 SNV,并与 244 项人体健康表型及环境暴露因素关联,最终鉴定出 940 个独立关联信号,涉及 101 种肠道细菌和 69 项表型或环境因素。分析显示,在 62,464 个物种—表型组合中有 533 个存在 SNV 层面关联,其中 460 个(86.3%)仅能在 SNV 层面观察到。
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来源:公众号:BioArt · mp.weixin.qq.com
推荐理由
研究把肠道菌关联从物种丰度推进到单碱基分辨率,并用蛋白结构把统计信号落到候选氨基酸位点。