NCBI 推出 RNA-Seq Gene Feature Counts 数据资源
NCBI 发布面向全部公开人类和小鼠 SRA 数据的 RNA-Seq Gene Feature Counts,通过 AWS Registry of Open Data 免费开放。
推荐理由:公共 SRA 的人和小鼠 RNA-Seq 数据有了统一流程算出的基因特征计数,做大规模表达分析前可先据此筛选。
NCBI 发布面向全部公开人类和小鼠 SRA 数据的 RNA-Seq Gene Feature Counts,通过 AWS Registry of Open Data 免费开放。
推荐理由:公共 SRA 的人和小鼠 RNA-Seq 数据有了统一流程算出的基因特征计数,做大规模表达分析前可先据此筛选。
Biohub、美国能源部(DOE)、美国国立卫生研究院(NIH)等资助方宣布扩大一项国际合作,共同投入 18 亿美元的资金、数据、算力和新测量技术,用于生成并开放可用于预测生物学 AI 模型的数据。Wellcome Sanger Institute、Human Cell Atlas、Human Protein Atlas、Allen Institute、Broad Institute 和 Gladstone Institutes 等机构参与其中,作为 Virtual Biology Initiative 的一部分推进。
推荐理由:这项跨国计划把测量技术、开放数据和标准化接口放在一起,可用来观察虚拟细胞类基础模型的数据底座如何搭建。
Biohub、美国能源部与 NIH 宣布投入 18 亿美元启动 Virtual Biology Initiative,用于生成开放、标准化的数据,训练预测细胞如何响应疾病与干预的 AI 模型。该计划定位为跨部门国际合作,目标是构建面向 AI 模型的基础数据。Loïc A. Royer 在 Bluesky 转述了这一消息并附上 biohub.org 的新闻链接。
推荐理由:这项近 20 亿美元的多机构投入指向开放标准化的细胞响应数据,为训练虚拟细胞类模型提供数据基础。
Isomorphic 宣布与美国能源部(DOE)和 NIH 建立重大合作,目标是生成构建准确细胞 AI 模型所需的数据。
推荐理由:美国能源部与 NIH 联合多家机构启动虚拟生物学计划,读者可了解细胞预测模型的数据来源与参与方。
Biohub 与美国能源部、NIH 及新资助伙伴宣布扩展虚拟生物学计划(Virtual Biology Initiative),合计投入 18 亿美元的资金、数据、算力和新测量技术。
推荐理由:这项跨机构投入给出了资金分配与数据标准化分工,可看清虚拟细胞所需开放数据从哪来、由谁整合。
研究团队发布人脑纹状体跨物种单细胞图谱,覆盖 109 个样本、69 名供体、67 万个细胞核,鉴定出 31 个神经元亚群,其中包括 9 类中型多棘神经元(MSN)。
推荐理由:这份跨物种纹状体图谱把 124 项 GWAS 的遗传风险定位到特定神经元亚群,并显示小鼠与人存在分区差异。
Nicolas Altemose 在 X 上反对削减美国联邦科研经费,称这类投入不仅推动医疗与技术,也稳定带动经济增长,削减将牺牲未来经济增长。他引用 Forbes 的一篇分析,该文称相关削减可能使美国经济每年损失 100 亿美元。
推荐理由:作者借 Forbes 分析指出削减 NIH 与 NSF 经费可能每年让美国经济损失 100 亿美元,为科研经费争论提供一个经济账视角。