物理限域调控肌动蛋白丝释放磷酸基团的限速转变

全原子分子动力学模拟显示，肌动蛋白丝中ADP-Mg2+活性位点释放无机磷酸（Pi）的计算解离速率与实验测得的Pi释放速率相关，并与γ-磷酸周围腔体内水分子数成反比。模拟表明，Pi经蛋白通道（包括N111-R177后门）的逸出并非限速步骤，丝末端亚基采用替代逸出路径。该工作用模拟刻画了丝内不同亚基的Pi释放过程，为解释丝末端与内部相同亚基释放速率显著不同的分子起源提供了依据。