RBPSignal：基于混合深度神经网络预测蛋白-RNA 结合信号

RBPSignal 是一个基于深度学习框架的计算工具，用于预测 RNA 结合蛋白（RBP）在 RNA 上的结合信号并识别与结合相关的潜在序列基序。该工具在多个 eCLIP 数据集上训练，预测准确度有所提升，并通过 Integrated Gradients 实现模型可解释性，用于分析结合基序的序列语法。研究在染色体数据上验证了 RBPSignal 的有效性，并将发现的基序与现有基序数据库比对，显示其既能预测结合信号，也能揭示与结合信号相关的序列模式。结果还揭示了 RBP 的序列特异性，并探索了蛋白-蛋白基序共享网络。RBPSignal 提供免费可用的网页服务器。