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Genome Biology·· 13 小时前AI 评分58

ReadsRatio:跨平台适用的 cfDNA 细胞类型解卷积方法

ReadsRatio: a facile method for cell type deconvolution with cross-platform applications

AI 导读

研究团队提出 ReadsRatio,通过细胞类型特异性标记区域内未甲基化 reads 的比例来估计组织比例,无需参考甲基化强度信号。在模拟数据和涉及狼疮、肾移植与 COVID-19 的临床队列中,该方法能检出特定组织的参与,并在不同测序平台和较低测序深度下保持准确性。作者初步估计这可以带来可观的成本节省,认为该框架适用于 cfDNA 解卷积的研究与临床场景。

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来源:Genome Biology · doi.org