ATLAS 实现小鼠脑跨遗传背景的空间单细胞转录组定位

研究团队提出 ATLAS（aggregate signatures 转录组定位），一种可扩展的组织定位方法：先从 scRNA-seq 数据学习转录特征，用数万条寡核苷酸探针原位编码并解码，从而推断细胞类型和插补转录组。作者用标记基因的 MERFISH 直接测量验证 ATLAS，并与另外四种技术做定量比较。他们分析了 5 只雄性、5 只雌性 C57BL/6J 小鼠和 5 只雄性 BTBR T+tf/J 特发性自闭症模型小鼠的中脑，覆盖 400 多张冠状切片、共 4000 万个细胞。