从单张快照空间转录组数据对空间表达梯度作运动学解释的框架

研究提出一个运动学框架，用于解释单张快照空间转录组数据中的空间表达梯度：在表达场位置条件平稳、细胞沿解剖轴平均位移为正的假设下，基因梯度的符号等于其净生成符号；但缺少独立速度估计时，该框架无法恢复绝对速率。作者在含 16 张标准 Visium 切片、3 张 Visium HD 切片及配套单核 RNA-seq 的人肝图谱上评估，主要跨供体分析使用 8 张活体供体切片；梯度方向可重复，严格 66 基因面板的跨供体平均相关为 0.87，宽泛 15,192 基因面板为 0.67。