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BMC Bioinformatics·· 14 小时前AI 评分58

LEEN:结合局部等变结构与进化信息的蛋白稳定性预测方法

LEEN: local equivariant energy networks with evolution-guided structural reasoning for protein stability prediction

AI 导读

作者提出 LEEN(Local Equivariant Energy Network),一种用于预测单氨基酸替换引起蛋白热稳定性变化(ΔΔG)的轻量方法,将突变效应表示为共享局部上下文下突变体与野生型能量之差,从而在代数上保证固定上下文的反称性;对两个突变方向使用同一对称化上下文时,对称化变体可扩展到精确反称性。方法用 E(n)-等变图神经网络编码突变位点周围的局部几何,并通过消息门控引入蛋白语言模型的进化信息来调节结构信息流,而不是直接拼接特征。

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来源:BMC Bioinformatics · doi.org