RETROFIT：一种无参考的空间转录组去卷积方法

RETROFIT 是一种无需单细胞参考的空间转录组去卷积方法，先对空间转录组数据做贝叶斯非负矩阵分解提取潜在表达成分，分解完成后再用单细胞参考或 marker 基因把成分匹配到细胞类型。作者用真实小鼠小脑 scRNA-seq 生成模拟 ST 数据，与 RCTD、Stereoscope、Cell2location 和 STdeconvolve 比较，在参考精确时 RETROFIT 与有参考方法竞争力相当，在参考混入无关细胞类型或缺失真实细胞类型时表现更稳定。