生成式 AI 模型用缩减氨基酸字母表设计定制二级结构多肽

研究团队开发并评估了一个生成式 AI 蛋白设计模型，用于以缩减氨基酸字母表（RAA）设计具有定制二级结构基序的新蛋白。模型在 RCSB PDB 中数十万个蛋白上训练，输入仅包含物理化学序列空间和二级结构信息。结果显示，在较宽的氨基酸字母表范围和不同设计复杂度下，模型整体上能设计出带有目标二级结构基序的新蛋白；对相当一部分设计，ESMFold 预测的折叠与目标结构接近。作者认为该模型可推动 AI 架构、生物技术蛋白设计以及天体生物学和早期地球演化生物学等方向的研究。