北京大学团队在 Nature Methods 发表 stVCR，从空间转录组快照推断细胞时空动态

北京大学李铁军、周沛劼等团队在 Nature Methods 发表 stVCR，一个从离散空间转录组快照推断连续细胞时空演化的生成式深度学习框架。该方法以不同时间点的空间坐标和降维基因表达为输入，用动态最优传输描述表达分布变化，用旋转平移不变的空间匹配校正坐标系，并用非平衡最优传输处理增殖和死亡带来的数量变化，三个神经网络联合学习空间迁移速度、表达变化速度和群体增长率，观测时间点少时可加入细胞状态转换与结构保持先验。