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斯坦福团队在Cell发表虚拟空间肿瘤图谱,CANVAS仅凭H&E切片还原肿瘤微环境空间结构
Cell | 斯坦福团队构建“虚拟空间肿瘤”图谱,仅依靠H&E染色切片,即可还原肿瘤微环境空间生态信息
AI 导读
斯坦福大学医学院团队联合Broad研究所、MD安德森癌症中心等机构在Cell发表研究,用41重CODEX空间蛋白组学解析457例非小细胞肺癌患者逾1800万个细胞,定义出10种保守的细胞邻域(CN),并开发基于病理大模型MUSK的AI平台CANVAS,从常规H&E切片预测这些空间结构。CANVAS在训练、验证和独立测试集上准确率>0.83、F1>0.79、Kappa>0.80。
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来源:公众号:生信人 · mp.weixin.qq.com
推荐理由
研究用41重CODEX数据定义肺癌细胞邻域,并让CANVAS从常规H&E切片还原这些空间结构,为空间分析的低成本落地提供参照。