通过高度粗粒化建模解析人肝磷酸果糖激酶-1的纤维状组织

研究团队构建了人肝磷酸果糖激酶-1（PFKL）四聚体的形状基刚体粗粒化模型，其相互作用位点取自实验解析的纤维形成界面，用于模拟大量 PFKL 四聚体的集体组装与组织。模拟考察了 Interface 1–Interface 1 与 Interface 1–Interface 2 两种相互作用模式的相对强度如何影响纤维形成与组装形态，并分析了类膜吸引表面对 PFKL 组织的影响，以及纤维形成对代表糖酵解组装潜在组分的通用客户蛋白空间共定位的作用。结果显示蛋白形状、界面特异性、表面结合、客户蛋白尺寸与相互作用强度共同影响高阶组织。